Theo đó, đến năm 2020, Phú Yên cơ bản chủ động thích ứng với biến đổi hậu bằng giải pháp giáo dục ý thức người dân chủ động phòng, tránh thiên tai, hạn chế tác động của triều cường, ngập lụt, xâm ngập mặn do nước biển dâng; hoàn thiện đánh giá tác động của biến đổi khí hậu, nước biển dâng, nhất là ở vùng ven biển. Tỉnh thực hiện chương trình sửa chữa, nâng cấp để đảm bảo an toàn các hồ chứa nước; bảo vệ và trồng mới rừng ngập mặn, rừng phòng hộ ven biển và rừng phòng hộ đầu nguồn theo quy hoạch. Trước mắt, tỉnh Phú Yên triển khai thực hiện Dự án kè chống xói lở đầm Cù Mông (thị xã Sông Cầu) và Đề án chống sạt lở bờ biển, cửa sông; thực hiện mục tiêu quốc gia về sử dụng năng lượng tiết kiệm và hiệu quả…  

Ngoài ra, trên lĩnh vực quản lý tài nguyên, Phú Yên hoàn thành lập quy hoạch, quản lý và khai thác nguồn tài nguyên đất, nước, khoáng sản, rừng, biển, đảo; lập bản đồ địa chất và tìm kiếm khoáng sản vùng biển ven bờ để làm cơ sở cho việc tổ chức khai thác, sử dụng và bảo vệ tài nguyên, phát triển kinh tế- xã hội vùng biển và ven biển. Tỉnh hạn chế tối đa, tiến tới chấm dứt xuất khẩu khoáng sản thô hoặc chỉ qua sơ chế; chấm dứt hoạt động đối với các mỏ nằm trong phạm vi khu đô thị hoặc gần các khu vực du lịch sinh thái, ảnh hưởng xấu đến cảnh quan, môi trường. Tỉnh kiểm soát và ngăn chặn tình trạng đánh bắt mang tính hủy diệt nhằm bảo vệ nguồn lợi thủy sản. Đến năm 2017, Phú Yên sẽ chấm dứt việc sử dụng đất sét sản xuất gạch nung; đồng thời khuyến khích các thành phần kinh tế tham gia đầu tư phát triển năng lượng mới, năng lượng tái tạo.